Проучване на рака на маточната шийка в Уганда помага на жените от Субсахарска Африка

Международен екип от учени проведе първото задълбочено и обширно геномно проучване върху рака на маточната шийка при жените от субсахарска Африка, в което са включени 212 жени от Уганда, диагностицирани с тумор. Откритията биха могли да доведат до много по-добро и навременно лечение на опасното заболяване.

Ракът на маточната шийка убива повече от 300 000 жени на средна възраст всяка година. 19 от 20-те страни с най-висока смъртност в резултат на този тип карцином, се намират в Субсахарския регион.

Експерти от няколко държави, сред които доктор Акиниеми Ойесина от университет „University of Alabama“ в Бирмингам, публикува първото подробно геномно проучване, свързано с рака на маточната шийка в субсахарска Африка. Ойесина е един от петимата изследователи, работили върху него, а резултатите са публикувани в „Nature Genetics.“

Според изследването подобни широкомащабни геномни анализи са много важни, особено в групи, които не са били взети под внимание досега или фокусът е бил твърде слаб. Целта на усилията на екипа е да се проучат молекулните фенотипове на този вид рак, което от своя страна да доведе до по-добро лечение.

Повечето участници са и ХИВ-позитивни

Особеното при изследването е, че то е първото по рода си, при което повечето пациенти са и ХИВ-позитивни. „Така успяхме да разграничим геномни особености при ХИВ-позитивни и при ХИВ-негативни пациенти“, казва Ойесина.

Той споделя, че благодарение на изследването ще могат да включат уникалните за африканските жени геномни особености в Геномния атлас на раковите болести. В него са обединени геномните анализи на много видове рак, включително 307 тумора на маточната шийка от различни места по света, но не и от Субсахарска Африка.

Ракът на маточната шийка се развива в нейните тъкани, по-точно в тясната долна част на матката. Постоянната инфекция с човешки папиломавирус е предпоставка, но не и задължително условие, за развитие на рак на по-късен етап. Той може да бъде избегнат с поставянето на ваксина, както и да бъде диагностициран навреме с PAP тест (по-популярен като цитонамазка). Проблемът е, че в слаборазвитите и бедни страни, в които случаите на ХИВ-позитивни са наистина много, хората нямат средства за ваксина или цитонамазка.

Как е извършен геномният анализ на рака на маточната шийка?

Геномният раков анализ е много сложен процес. Той съдържа в себе си немалко други анализи, на различни нива.

• Цялостно геномно секвениране

В началото учените насочват вниманието си към мутациите в ДНК на туморните клетки. По-лесният начин е да се ограничат само до места в генома, където се забелязват диспропорции в гените. Настоящото проучване на Ойесина се фокусира върху цялостното геномно секвениране (определянето на пълна ДНК последователност) на всички взети проби, обратното на цялостното екзомно секвениране, което помага на екипа да открие некодиращи алтерации.

• Генни експресии

На следващ етап от проучването експертите разглеждат генните експресии, за да открият кои гени са със свръхекспресия и кои – не. Именно тази фаза им помага да разберат пътищата, по които туморът предизвиква растеж на рака, а така от своя страна специалистите ще могат по-бързо и адекватно да назначат лечение.

Част от експресионния анализ включва разглеждане на немутиращи, или епигенетични, промени, които биха могли да повлияят върху регулацията на гените. Учените следят за добавени или изчезнали метилови групи при ДНК, както и за промени в метилирането или ацетилирането на протеините хистони, които помагат за скъсяването на ДНК в човешките хромозоми. Варианти на хистони, регулиращи генната експресия, са открити в различни тумори на жени от Уганда, участвали в изследването.

• Видове човешки папиломавирус в тумора

Следващата стъпка за екипа е да се проучи кои видове човешки папиломавирус се намират в самия тумор. Двата вида, които най-често се свързват с рака на маточната шийка, са HPV-16 и HPV-18. Всеки вид има различни подвидове, като онези, които са изградени само от един вид човешки папиломавирус, се наричат разклонения. Подвидовете на вируса HPV-16 се намират в разклонение A9, а тези на вирус HPV-18 – в разклонение A7. Изследването успява да опише молекулните характеристики на всяко разклонение, включително струпванията от деференциални генни експресии или неправилни регулации, свързани с разклоненията. Туморите, причинени от вирус в разклонение A7 например, са с признаци на генна експресия, които подсказват за извънклетъчен матрикс, клетъчна адхезия и миграция – доказателства за по-агресивен вид тумор.

Резултати от проучването на рака на маточната шийка

Учените откриват разлики между туморите в зависимост от това дали човешкият папиломавирус е навлязъл в хромозомите, или не. Ако вирусът е навлязъл, местата на проникването му определят каква ще е генната експресия.

И накрая, изследователите забелязват, че определени начини на навлизане при жените с тумор от Уганда водят до експресия на ендогенни ретровируси, чиято повишена регулация се свързва с модификации при хистоните. Тези ендогенни ретровируси, които се откриват в нормалните хромозоми, са следи от предишни ретровирусни инфекции, представляващи около 8% от човешкия геном. При здравите хора те съществуват в състояние на покой в човешките клетки, но при заболяване е възможно да се активират.

Международното проучване е финансирано от Националния институт по ракови заболявания към Службата по ракова геномика. Екипът на Ойесина от университета на Алабама в Бирмингам играе ключова роля при откритието на някои соматични геномни алтерации и уникални по своя вид особености на човешкия папиломавирус. В изследването вземат сериозно участие и експерти като Марко Мара, Джанет Рейдър от Медицинския колеж в Уисконсин, САЩ и други.